Polos Sindicais
Além das instâncias que compõem a estrutura orgânica do MSTTR, no estado há também os polos sindicais que são compostos por diversos sindicatos circunvizinhos.
A divisão de sindicatos inicialmente se deu em torno dos atendimentos realizados pelas Agências da Previdência Social no começo dos anos 1990, concretizando-se em 1995, para discutir a problemática da previdência social vivida pelos trabalhadores e trabalhadoras rurais.
Contudo, logo em seguida se notou a necessidade de se agrupar sindicatos por outros critérios identitários com especificidades territoriais (atividades produtivas, cultura, educação, entre outras).
Atualmente, o MSTTR de Sergipe está organizada geograficamente em cinco polos sindicais, a saber:
Baixo São Francisco:
Amparo do São Francisco; Aquidabã; Brejo Grande; Canhoba; Cedro de São João; Ilha das Flores; Japoatã; Malhada dos Bois; Muribeca; Neópolis; Pacatuba; Propriá; Telha; São Francisco; Santana do São Francisco.
Sertão:
Canindé de São Francisco;  Cumbe, Feira Nova; Gararu;  Graccho Cardoso; Itabi; Monte Alegre; Nossa Senhora das Dores; Nossa Senhora de Lourdes;  Nossa Senhora da Glória; Poço Redondo; Porto da Folha.
Centro-sul:
Areia Branca; Campo do Brito; Carira; Frei Paulo; Itabaiana; Macambira; Malhador; Moita Bonita; Nossa S. Aparecida; Pedra Mole; Pinhão; Poço Verde; São Domingos; São Miguel do Aleixo; Simão Dias; Tobias Barreto.
Cotinguiba:
Barra dos Coqueiros; Capela; Carmópolis; Divina Pastora; General Maynard; Japaratuba; Laranjeiras; Maruim; Nossa Senhora do Socorro; Pirambu; Riachuelo; Rosário do Catete; Santa Rosa de Lima; Santo Amaro das Brotas; Siriri; São Cristóvão.
Sul:
Arauá; Boquim; Cristinápolis; Estância; Indiaroba; Itabaianinha, Itaporanga D’Ajuda; Lagarto; Pedrinhas; Riachão do Dantas; Salgado; Santa Luzia do Itanhy; Tomar do Gerú; Umbaúba.
Desse modo, os polos sindicais se constituÃram em importantes espaços de organização e articulação territorial para o fortalecimento de ações estratégicas em prol dos trabalhadores e trabalhadoras rurais.